しかし第三次忍界大戦で任務の最中、同じ「ミナト班」に所属するのはらリンが攫われてしまいます。任務の遂行を優先しようとしたカカシですが、リンの救出を主張するオビトのオビトの
「忍者の世界でルールや掟を破る奴はクズ呼ばわりされる……けどな！ 仲間を大切にしない奴はそれ以上のクズだ」
との言葉に感化され、リンの救出に向かうことになります。
しかし救出作戦のさなかカカシは左目を負傷してしまいます。それを庇ったオビトも、右半身を岩に潰され重症に。
瀕死のオビトは敵との戦いで開眼した左目の写輪眼をカカシに託すことを決意し、リンの医療忍術でカカシは写輪眼を負傷していた左目に宿します。
この事件を期にカカシの性格は変化し、現在のような温和な性格になりました。また、よく集合に遅刻するのは、オビトの名が刻まれている慰霊碑に行っているため、ということが明かされています。
はたけカカシが火影に！？
第四次忍界大戦終戦の１年後、はたけカカシは五代目火影の綱手から火影の座を継ぎ、六代目火影に就任します。
続編のBORUTO（ボルト）では火影の座をナルトに譲り、ナルトのサポートに回っています。
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